วัคซีนป้องกันไข้หวัดใหญ่จะมีประสิทธิภาพสูงสุดเมื่อไวรัสที่หมุนเวียนเข้ากันได้ดีกับไวรัสที่อยู่ในวัคซีน เนื่องจากธรรมชาติของไวรัสไข้หวัดใหญ่มีการพัฒนาอย่างต่อเนื่อง ระบบการเฝ้าระวังและตอบสนองไข้หวัดใหญ่ทั่วโลกขององค์การอนามัยโลก (GISRS) ซึ่งเป็นระบบของศูนย์ไข้หวัดใหญ่แห่งชาติและศูนย์ความร่วมมือขององค์การอนามัยโลกทั่วโลก จึงติดตามตรวจสอบไวรัสไข้หวัดใหญ่ที่แพร่ระบาดในมนุษย์อย่างต่อเนื่องและปรับปรุงองค์ประกอบของ ไข้หวัดใหญ่ วัคซีนปีละสองครั้ง เป็นเวลาหลายปีที่องค์การอนามัยโลกได้ปรับปรุงคำแนะนำเกี่ยวกับองค์ประกอบของวัคซีน (ไตรวาเลนท์) ที่กำหนดเป้าหมายไวรัส 3 ชนิดที่แพร่ระบาดมากที่สุด (ไวรัสไข้หวัดใหญ่ A 2 ชนิดย่อยและไวรัสไข้หวัดใหญ่ B 1 ชนิด) เริ่มตั้งแต่ฤดูกาลไข้หวัดใหญ่ซีกโลกเหนือปี 2556-2557 แนะนำให้ใช้องค์ประกอบที่ 4 เพื่อสนับสนุนการพัฒนาวัคซีนสี่ส่วน วัคซีนสี่วาเลนต์รวมไวรัสไข้หวัดใหญ่ชนิดที่ 2 เพิ่มเติมจากไวรัสในวัคซีนไตรวาเลนต์ และคาดว่าจะให้การป้องกันการติดเชื้อไวรัสไข้หวัดใหญ่บีที่กว้างขึ้น วัคซีนไข้หวัดใหญ่ชนิดเชื้อตายและวัคซีนไข้หวัดใหญ่ชนิดผสมมีจำหน่ายในรูปแบบฉีด วัคซีนไข้หวัดใหญ่ชนิดเชื้อเป็นมีให้ในรูปแบบสเปรย์ฉีดจมูก