สาเหตุที่แท้จริงของ PCOS ยังไม่ทราบ อย่างไรก็ตาม นักวิจัยเชื่อว่าการทำงานร่วมกันระหว่างปัจจัยทางพันธุกรรมและสิ่งแวดล้อมมีส่วนทำให้เกิดโรค งานก่อนหน้านี้ได้ตั้งสมมติฐานว่า B-cells มีบทบาทสำคัญใน PCOS แม้ว่าจะยังไม่ทราบกลไกของการเชื่อมโยงนี้ ภาวะมีบุตรยาก การวิจัยเกี่ยวกับหนู mu heavy chain knockout (MuMt -  B null ) ซึ่งเป็นหนูที่ไม่สามารถผลิต B-cells ที่โตเต็มที่ได้ทางพันธุกรรม ได้เสนอว่า B-cells ขยายผลการเผาผลาญของโรค โดยเฉพาะอย่างยิ่งโรคเบาหวานและการดื้อต่ออินซูลิน เนื่องจากโรคเบาหวานประเภท 2 (T2D) และภาวะต่อมไทรอยด์ทำงานเกิน ซึ่งทั้งสองอย่างนี้เป็นภาวะภูมิต้านตนเอง มีความสัมพันธ์อย่างมากกับ PCOS นักวิทยาศาสตร์จึงพยายามตรวจสอบตัวกระตุ้นภูมิต้านทานผิดปกติสำหรับ PCOS ซึ่งยังไม่ประสบผลสำเร็จ